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通風柜主要作用是抑制柜內產生的危害性化學氣體防止其泄漏，并盡快將其排出實驗室，保護實驗室員工的安全。當啟用通風柜時，操作者站在通風柜前，伸手進入通風櫥內部進行實驗操作時，氣流會在操作者身邊形成旋轉氣流，從而引起柜內氣體溢出，甚至是沿操作者身體到呼吸區域。進口風速越大，形成的旋轉氣流就越強
在相對很理想操作環境下，如果通風柜氣流抑制性能很出色，那么進口風速在0.3-0.41m/s可保證充足的氣流抑制，但是抑制性能會在這個范圍內有所波動，需要制定有效實驗室操作規范，并嚴格執行。通風柜進口風速在0.41-0.51m/s，氣流抑制性能也會產生波動，但是該風速適合絕大多數通風柜低風險運作，適用于大多數實驗室化學實驗，依舊要嚴格執行有效實驗室操作規范。
確保通風柜清潔干凈
當通風柜處理過具高毒性、高殘留性或性的物質后，應立刻對通風柜內部加以清潔及去除污染。
被污染之通風柜應掛上一明顯的警示牌，并告知維修人員那些管路系統可能會被污染，以免傷及維修人員。
通風柜內不可儲存任何物品
實驗室通風柜不應該做為替代化學品儲存柜而于柜內儲放化學物品，通風柜會因為柜內儲放過多的物品以及有效工作空間縮減而造成性能降低。
使用通風柜基本常識
1.保證實驗室換氣次數
通常情況下，我們認為實驗室應保證6－12 次/小時的換氣次數。如果將排風系統如通風柜排風作為實驗室氣流控制的一級控制，則通常要求保證換氣次數為4－12 次/小時。但是當實驗室有較大的排風要求（較多通風柜）或實驗室內熱負荷較高（如有較多分析設備）時，可能會要求更多的換氣次數。
2.防止氣流交叉污染
保障實驗室氣流不斷更新，防止在工作日實驗室內的氣體濃度增加。所有化學實驗室內的空氣都應被排放出室外而不得循環使用。因此，要保證實驗室內衡為負壓，實驗室不會對周邊區域形成交叉污染。
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